常見床單位消毒機的方式主要有以下幾種： 

1、巴氏消毒

在60～66℃的溫度下，可以把大部分營養菌殺死，如雙孢菇培養料的后發酵過程，能殺死有害于蘑菇的雜菌和害蟲。

2、沸水消毒

主要用于金屬器具、針筒等的消毒。在沸水中燒煮20～30分鐘，可殺死微生物的營養體，細胞芽孢則需1～2小時才能殺死。若在水中加入2%～5%的碳酸溶液少許，可大大縮短消毒時間；加入1%碳酸氫鈉可提高水的沸點，加速芽孢死亡，并能防止金屬器械因燒煮而生銹。

3、干燥消毒

利用物質干燥使微生物失水，以達到殺菌或抑菌的目的。微生物細胞含有70%～90%的水分，微生物失水后就會趨向死亡。人們常利用這一特性來對食品（如干香菇、木耳）、藥品等作較長期的保存。

4、滲透壓消毒

利用高滲透壓或低滲透壓殺菌或抑菌的方法稱滲透壓消毒。通常用的鹽溶液濃度為20%左右，糖溶液濃度為50%～70%。